Kogoro Mouri menerima sepucuk surat yang isinya mengharapkan bantuan . Akhirnya, bertiga dengan Conan dan Ran, mereka menuju sebuah rumah yang banyak terdapat jam aneh. Antara angka 0, terdapat goresan, seperti sandi. Seorang murid pindahan yang aneh datang. Dia mengetahui identitas Conan yang sebenarnya. Pada saat yang bersamaan, terjadi kasus pemalsuan uang disusul dengan pembunuhan seorang profesor.