Judul asli : [Junior Bunko] Meitantei Conan Konpeki No Jolly Roger ; Pulau Koumi memiliki legenda harta yang konon ditinggalkan oleh bajak laut wanita 300 tahun lalu. Sebagian harta itu telah ditemukan, sehingga mengundang wisatawan dan para pemburu harta yang mengincar harta tersebut. Saat rombongan Conan yang datang untuk berlibur ke pulau tersebut ikut bermain mencari harta, terjadi kasus pembunuhan yang menargetkan pemburu harta! Mereka juga bertemu rombongan inspektur Megure yang datang karena kasus lain dan memulai investigasi. Setelah itu, harta yang ditemukan di istana bawah laut yang dipamerkan di Pusat Informasi Wisata dicuri!