Komik yang menceritakan tentang seorang detektif SMA yang terkadang bekerjasama dengan polisi, Shinichi Kudo mengadopsi nama Conan Edogawa menjadi nama samaran untuk menutupi identitas aslinya. Kudo yang tinggal bersama teman masa kecilnya–Ran Mouri, juga tinggal bersama ayahnya yang seorang detektif swasta–Kogoro Mouri. Dalam petualangannya memecahkan kasus, Kudo ditangkap dan berusaha dibunuh oleh sindikat kejahatan–Organisasi Hitam. Namun, bukannya membunuh, obat yang diduga bisa membunuh Kudo malah merubahnya menjadi anak kecil.