Dalam kitab Fawa'id Al-Amir karya Hamiduddin disebutkan perbedaan antara Al-Qur'an dan Hadist Qudsi sebanyak enam sisi perbedaan : Pertama, Al-Qur'an mengandung i'jaz, sedangkan Hadist Qudsi tidak memiliki i'jaz. Kedua, Shalat tidak sah kecuali dengan membaca Al-Qur'an, tidak boleh dengan membaca Hadist Qudsi. Ketiga, Orang yang mengingkari keberadaan dihukumi kafir, berbeda halnya dengan orang yang mengingkari Hadist Qudsi, orang itu tidak dihukumi kafir. Keempat, Dalam menurunkan Al-Qur'an, Jibril selalu menjadi perantara antara Nabi dengan Allah, berbeda halnya dengan Hadist Qudsi. Kelima, Lafadz Al-Qur'an haruslah dari Allah, berbeda halnya dengan Hadist Qudsi. Keenam, Al-Qur'an tidak boleh disentuh kecuali dalam keadaan bersuci, sedangkan Hadist Qudsi boleh disentuh oleh orang yang sedang hadast sekalipun.