Sultan Agung Hanyakrakusuma lahir pada tahun 1593 di Kotagede, dengan nama Raden Mas Jatmiko. Ayahnya adalah Panembahan Hanyakrawati, Raja kedua Mataram. Sedangkan ibunya, Ratu Mas Hadi Dyah Banowati adalah putri Pangeran Benawa, Sultan Pajang terakhir. Karena terlahir dari garwa padmi kedua, Raden Mas Jatmiko kedudukannya bukan sebagai putra Mahkota. Raden Mas Jatmiko atau Raden Mas Rangsang atau Sultan Agung Hanyakrakusuma naik tahta pada tahun 1613 M menggantikan adik tirinya, Pangeran Adipati Martapura yang menjadi raja Mataram hanya dalam waktu satu hari. Sultan Agung Hanyakrakusuma mendapat gelar “Sultan Abdullah Muhammad Maulana Matarani” dari kerajaan Arab. Gelar tersebut dipakai sejak tahun 1641 M, dan sebagai ucapan terima kasih beliau mengirim uang 6000 real untuk disedekahkan ke makam Nabi Muhammad SAW.